Глава организации Nerv, 48 лет. Несёт ответственность за все исследования, посвящённые Евангелионам, Рей Аянами и проекту совершенствования человечества. Отец Синдзи. Опекун Рей.
Хладнокровный, невозмутимый и замкнутый человек. Крайне скуп на эмоции к своему сыну, холоден к нему. В полнометражном фильме «Конец Евангелиона» Гэндо откровенно признаётся призраку жены, что он тяжёлый человек и плохой отец: «Я не могу поверить, что кто-то может меня любить» и «Когда я рядом с Синдзи, я только причиняю ему боль». Гэндо не знает, как ему следует вести себя со своим сыном. Он холодно относится к Синдзи даже по сравнению с отношением к другим. Гэндо полностью поглощён своей работой. Всегда спокоен и сосредоточен. Много времени проводит с Рей, относится к ней несколько теплее, чем к остальным людям. В начале сериала он единственный человек, который имеет дружеские отношения с Рей. По мере того, как открывается его прошлое, становится ясно, что он очень сильно любил свою погибшую жену — Юи.
