Мир сериала представляет собой сочетание стимпанка и феодальной Японии. Среди людей распространился вирус, превращающий их в мертвецов-кабанэ — агрессивных монстров, убить которых можно лишь уничтожив сердце, закрытое слоем железа. Холодное и работающее на пару огнестрельное оружие, используемое самураями, оказалось неэффективным. Для защиты от кабанэ люди построили станции-крепости, используя для передвижения между ними укреплённые локомотивы.
Однажды в город Араганэ врывается локомотив, угнанный кабанэ, из-за чего они наводняют город. Юный механик Икома использует эту возможность, чтобы проверить «Пронзающий ствол» — разработанное им оружие. Ему это удаётся, но в время борьбы с кабанэ он оказывается укушен. После попытки остановить вирус он становится кабанэри — гибридом кабанэ и человека. Вместе с Мумэй и другими выжившими он ищет кров, преодолевая орды кабанэ на «Железной крепости».